(🌠) 经过了十个世纪，大约(🐌)在(🍩)198X年的某一天，阿特姆施(🎺)莱德在日(rì )本收(🐉)养了义女唐(🏴)井(jǐng )(恰巧是天狗(gǒu )施莱德(dé )小禄崎的直系(♑)血缘(yuán )传人(🖲))，并传(🔸)授了(le )(🎩)她(🤷)有关忍者的一切，可能是考虑(lǜ )到地球科(🕌)技的发(fā )展(zhǎn )让他即将可(✖)能回到太空，所以(yǐ )他将唐(táng )井立为自己(jǐ )的继(📎)承(chéng )人，并告诉了(🚨)她自己(jǐ )是(shì )外星(❔)人的(de )一切(qiē )真相(xiàng )。随后(💻)跟(🗞)随地(📙)球上(✋)其它逃(🙌)亡(wáng )阿特姆的消息，阿特姆(mǔ )施莱德转战来到(dào )了(🧤)美(🔔)国，并(🕙)且(qiě )很(😍)快(kuài )(💠)拥有(yǒu )了纽约市长颁发(🧟)的城市金钥匙，成为纽约最大的(💔)资(zī )产家，家财万贯，同时拥(➡)有全市最(zuì )高的大厦，并且控制(zhì )着整(📟)个城市(shì )的黑(hēi )势(🙎)力。
(😙) 同一(yī )时(shí )间里(lǐ )施(📸)莱德残(👵)忍的(💸)杀害(🐞)了身在(🔞)美(🏴)国的守护者滨(bīn )户良大师，所谓(🔥)守(shǒu )护(🌸)者是地(🏓)球上崇拜并保护阿(ā )(👗)特(🎦)姆流亡者的战士，因为(wéi )滨户良(liáng )在此之前曾经几(jǐ )次(cì )请求讨伐过天狗施莱德的(de )五龙(lóng )忍(🍯)者(🔍)裁判所帮忙打败这(zhè )名阿特姆施(shī )莱德，但是裁判所表示(shì )他(📯)们只(zhī )(♊)关(👆)心被封印(yìn )起来的(de )天狗，认(🏖)为(🍝)这是施莱德个(😼)冒牌货(♟)，所以没有必(♈)要与其一(yī )般见识(😂)。这一(yī )情况惹(rě )恼了阿特姆施莱德，之后因为朋(🍂)友的(de )背叛(pàn )，滨户(hù )良(👎)随(❗)阿(ā )特(😓)姆流亡者们转移逃离了日(rì )本，但终究(🤙)还(hái )是在(⛄)美国被杀害(🍆)了。
侥(yáo )幸逃(táo )脱的(💦)滨户良的宠物(wù )鼠斯普(🧖)林特意外(wài )的与另外(👉)四只(zhī )(♿)乌龟(guī )在纽约下(🖨)水道沾染(🔘)上了(le )由(yóu )(📻)阿(🏈)特姆所制作(zuò )的变异液体，变成了接近人形的变异(yì )(⏫)生(shēng )物(wù )，也(🎁)就诞生了新一代的忍者(💻)神(🈹)龟，斯普林特(tè )开始训练这些乌龟们滨户良留(liú )下的(de )忍者功(🐋)夫和(🈵)知(😎)识，希(xī )望有朝一日能为自(🔄)己的(de )主人(rén )复仇。2003年的某(🤮)一(yī )天，已经长大并初露(😇)锋(fēng )(🧜)芒的忍(🐩)者神(shén )龟(guī )(☕)们(🕎)终于遇到了他们(men )的宿敌，施(📀)莱(lái )德(dé )试图拉拢神龟之一的李奥(ào )纳多为(wéi )自己服务，但(dàn )是惨遭失败，露出邪恶本性(xìng )的阿特(tè )姆施(🈴)莱(🥑)德与神龟们开始了第一战，最(zuì )后在(👵)斯(sī )普林(☔)特出手(🥟)帮助(👎)下众人(rén )(🔀)合力将其击退。过(guò )了(🤜)一段(🍚)日子(🙂)，施莱德展开了复(🎷)仇，并将李奥打成重(chóng )(📊)伤(🐋)，在朋友帮(bāng )助下逃过，休养生(shēng )息后神(shén )龟(guī )们(men )返回纽(🈷)约(🔪)与施(shī )(🔢)莱(🚊)德展开第二次较(jiào )量，最终(zhōng )施莱德被(♑)李奥(👆)用腾古(gǔ )之剑(jiàn )砍下脑(🏻)袋，但是我们(🧔)知道这只是他的机器外壳，而神龟们的代价则是(shì )失(shī )去(qù )了他(🐕)们的父亲:斯(sī )普林(lín )特的踪(🎓)迹(jì )……为(🐞)了(le )寻(xún )找失(shī )踪的父(fù )亲，神龟们结识了(le )阿(ā )特姆流(liú )亡者一族并且了解(🏺)了他们的历史(shǐ )，但是(😢)就在这时(shí )，施(shī )莱德再(zài )度出(chū )现(🔄)了(🥇)，一番(🚴)大战后，施莱德露(lù )出了(🍉)他(🏆)的真面目，眼见阿(♌)特姆(mǔ )(🍯)一族利用(yòng )(🤯)传送门逃离地(⛲)球，千(🎿)年的(⛄)复仇计划毁于一旦，施(shī )莱(🆔)德(dé )气急败坏的要(yào )(🛠)与(🤤)神(shén )(🕊)龟们(🚠)同归于尽，而(ér )最终神龟们利用传送门(🐥)逃生(shēng )，施莱德(dé )则(zé )在一(🏷)片爆炸声中消失(🌕)了踪(zōng )迹……